在《口袋妖怪黑2》的一周目流程中，玩家将从双龙市开始冒险，逐步挑战道馆、捕捉宝可梦，并最终击败四天王与冠军。游戏初期，玩家需要选择自己的初始宝可梦——水系的暖暖猪、草系的芽芽和火系的爆香猴。选择时需根据个人喜好与策略进行考虑，芽芽在后期进化为蜥蜴王，拥有较强的特攻能力；暖暖猪则进化为水系的帝王拿波，适合新手；爆香猴虽然在初始阶段较弱，但进化为炎武王后具备强大的物攻能力。

游戏开始后，玩家会接到前往飞龙洞窟的任务，途中需经过双龙市的训练家挑战。在击败对手后，获得道具“头巾”。随后，玩家进入飞龙洞窟，这里需要使用“冲浪”技能才能完成探索。洞窟中可遇到野生宝可梦如妙蛙种子、杰尼龟等，建议在此处捕捉一只水系宝可梦，为后续战斗做准备。完成洞窟任务后，返回双龙市并获得“冲浪”技能，这将成为后续探索的重要工具。

接下来，玩家需要前往三曜市挑战第一个道馆。道馆训练家使用虫系宝可梦，建议使用火系、飞行系或岩石系技能进行克制。击败道馆馆主后，获得虫系徽章与技能“闪光”。随后，玩家继续前往飞云市，在这里将遇到第二个道馆，由使用格斗系宝可梦的馆主镇守。此时，玩家需注意队伍中是否有克制格斗系的超能力、飞行或妖精系宝可梦。击败道馆后，获得格斗系徽章与技能“碎岩”。

随着游戏推进，玩家将解锁更多技能，例如“怪力”、“攀瀑”等，这些技能允许玩家进入此前无法到达的区域。在飞云市后，玩家需前往雷文市挑战第三个道馆，该道馆使用超能力系宝可梦。建议使用虫系、恶系或幽灵系技能进行对抗。击败馆主后，获得超能力系徽章与技能“冥想”。此后，玩家将前往雪花市挑战冰系道馆，推荐携带火系、格斗系或岩石系宝可梦，以应对寒冷对手。

在挑战道馆的同时，玩家还需完成主线剧情任务，例如帮助N建立理想国度，或协助联盟调查组织。在某些关键剧情点，玩家会获得重要道具，如“秘传学习器”、“传说宝可梦图鉴”等。玩家还可通过“连接交换”或“神秘礼物”功能获取限定宝可梦，例如梦幻、洛奇亚等。

当玩家收集到八个徽章后，即可挑战联盟。联盟四天王各有特色，第一王使用幽灵系宝可梦，第二王使用地面系，第三王使用龙系，最后一位则是冠军艾莉丝，使用龙系与妖精系组合。建议队伍中携带钢系、冰系、龙系或妖精系宝可梦，以应对不同对手。击败冠军后，玩家成为新任联盟冠军，但游戏并未结束，后续还有大量支线任务与隐藏内容等待探索。

通关后，玩家可继续完成全国图鉴，捕捉未获得的宝可梦，挑战超级训练师，或参与联机对战。游戏中隐藏着多个秘密地点，如“龙螺旋之塔”、“冠军之路”等，这些区域可遇到高难度野生宝可梦或传说宝可梦。建议玩家在通关前做好充分准备，提升队伍等级，学习强力技能，并携带足够道具，以应对后续挑战。